Accel World VS. Sword Art Online bắt đầu khi bức tường ngăn cách giữa hai thế giới Sword Art Online và Accel World biến mất, tạo nên hỗn loạn cho cả hai bên. Trong tình thế đó, nhóm Kirito bên Sword Art Online lại bị lạc mất một người bạn của mình và Black Lotus bên Accel World thì lại đang manh nha đánh phá nơi đây. Dĩ nhiên sẽ không ai có thể đứng nhìn điều đó xảy ra, những nhân vật chính ở hai thế giới cũng nhận ra điều đó và họ quyết tâm hơp sức để chống lại Black Lotus.

Hệ thống chiến đấu vẫn sẽ theo lối đánh tự do theo thời gian thực, và hơn hết, game sẽ có hơn 30 nhân vật với những điểm mạnh yếu khác nhau và đặc biệt là mỗi người sẽ có kĩ năng và tuyệt chiêu riêng, không ai giống ai và tất cả đều bám sát nguyên tác trên hai bộ tiểu thuyết cùng tên nên chắc chắn sẽ chiều lòng được những fan khó tính nhất.