Jedi Fallen Order diễn ra ngay sau sự kiện trong Star Wars: Revenge of the Sith (Sự báo thù của người Sith). Hoàng đế ban hành Order 66 nhằm săn tìm và diệt gọi bất cứ Jedi nào bi coi là phản bội đến Cộng Hòa Thiên Hà. Nhân vật chính của phần game này là một người học việc có tên Cal Kestis, do Cameron Monaghan thủ vai trong phim, là một trong số những người sống sót của Order 66. Ngoài việc cố gắng hoàn thành khóa huấn luyện trở thành một Jedi, Cal cũng sẽ thực hiện một hành tình nhằm tìm nhặt những mảnh quá khứ bi thảm của mình.