Móng vuốt sắc lẻm của Wolverine, nắm đấm hủy diệt của HULK,  di chuyển như SpiderMan hay Prince of persia, các màn chặt chém đã tay như Darksider ... tất cả hội tụ ở ALEX MERCER - người hùng siêu nhiên mới vừa ra mắt qua tựa game hứa hẹn nhiều hấp dẫn PROTOTYPE.

Siêu nhân này còn có thêm khả năng khả năng đặc biệt là hấp thu và biến hình thành người mình vừa hạ gục để ngụy trang trong tình huống cần thiết và có được những kỹ năng đặc biệt của họ. Ví dụ như muốn điều khiển các chiếc xe tăng và máy bay trực thăng, bạn phải "hấp thu" được viên sĩ quan có khả năng điều khiển chúng. Có thể nói Prototype là sự gặp nhau của Wolverine, Spiderman và The Hulk trong bối cảnh của GTA. Nhân vật chính của trò chơi mang tên Alex Mercer, một người hoàn toàn không có kí ức và một sức mạnh siêu nhiên tìm mọi cách để tìm lại thân thế của chính mình.Có quyền năng siêu nhiên nên toàn thân Alex là thứ vũ khí hủy diệt khủng khiếp cùng vô số kỹ năng đặc biệt. Anh có thể chạy men theo bờ tường lên nóc các toà nhà cao chót vót, rồi từ đó nhảy xuống tạo ra các pha va chạm khủng khiếp mà không hề hấn gì. Với sức mạnh phi thường, việc nắm lấy các vật nặng và xe cộ để ném về phía đối thủ chỉ là chuyện nhỏ. Alex có thể sử dụng những móng vuốt sắc lẻm làm vũ khí như anh chàng Wolverine của X-Men, mà khi nâng cấp lên thì nó có thể biến thành những chiếc gai nhọn khổng lồ luồn dưới đất để tấn công mục tiêu từ xa cực kỳ ấn tượng. Nắm đấm của Alex có thể biến thành chiếc búa tạ khổng lồ đập vỡ chiếc chiến xa bọc thép vững chắc nhất, hoặc biến thành tấm khiên bảo vệ mình an toàn trước mọi hỏa lực của đối thủ. Có thể nói cánh tay của Alex có khả năng biến hóa và hữu dụng hơn gấp nhiều lần so với "đồ chơi" của các nhân vật khác như móng vuốt của Wolverine hay lưỡi phi đao 3 cạnh mọc từ tay của Hayden (Dark Sector). Alex cũng có thể nhặt lấy những thứ vũ khí rơi ra từ các binh lính để sử dụng. Tuy nhiên, ai lại cần đến các thứ vũ khí có hỏa lực không mạnh lắm và lại mau hết đạn trong khi trong người sẵn có những thứ vũ khí hủy diệt mạnh mẽ.