Trong Soldier of Fortune: Payback, người chơi sẽ không tiếp tục vào vai người hùng John Mullins như hai bản Soldier of Fortune trước.Lần này, câu chuyện tương đối đơn điệu và dễ hiểu. Có một anh lính đánh thuê ngay trong phần chơi đầu tiên có nhiệm vụ bảo vệ một nhà ngoại giao, nhưng sau đó bị phản bội và buộc phải truy tìm kẻ thù trong cuộc đối đầu với một tổ chức khủng bố quốc tế. Như những game hành động chạy và bắn khác, công việc của người chơi đơn giản chỉ là tiến lên, tiêu diệt địch và hoàn thành các nhiệm vụ.